Wśród licznych korzyści przypisywanych regularnie wykonywanym ćwiczeniom fizycznym wymienia się również zmiany w funkcjonowaniu układu pokarmowego. Udowodniono, że aktywność fizyczna usprawnia motorykę jelit, przeciwdziała zaparciom, normalizuje apetyt, jak również zmniejsza ryzyko wystąpienia takich chorób, jak kamica żółciowa, choroba wrzodowa dwunastnicy, czy nowotwory żołądka i jelita grubego. Jednakże równocześnie u osób trenujących obserwuje się znacznie częstsze występowanie infekcji górnych dróg oddechowych oraz zaburzeń żołądkowo-jelitowych w porównaniu do osób nieaktywnych fizycznie. Zaburzenia te mogą istotnie ograniczyć aktywność fizyczną, a tym samym korzystne efekty jej podejmowania.
